Difference between revisions of "Template:GlycolysisGluconeogenesis WP534"
imported>Frietjes |
imported>WOSlinker (use internal links) |
||
| Line 5: | Line 5: | ||
|Image={{Annotated image |float=none|image-width=1015|annot-color=white|imagemap=<imagemap> | |Image={{Annotated image |float=none|image-width=1015|annot-color=white|imagemap=<imagemap> | ||
Image:WP534.png|right|alt=GlycolysisGluconeogenesis_WP534 | Image:WP534.png|right|alt=GlycolysisGluconeogenesis_WP534 | ||
| − | rect 222.5 823.0 322.5 843.0 [ | + | rect 222.5 823.0 322.5 843.0 [[2-Phosphoglyceric_acid|go to article]] |
| − | rect 695.6666666666667 1192.0 759.3333333333334 1212.0 [ | + | rect 695.6666666666667 1192.0 759.3333333333334 1212.0 [[Dihydrolipoyl_transacetylase|go to article]] |
| − | rect 801.0 1024.6666666666667 901.0 1044.6666666666667 [ | + | rect 801.0 1024.6666666666667 901.0 1044.6666666666667 [[Malic_acid|go to article]] |
| − | rect 555.3333333333333 986.1666666666673 615.3333333333333 1006.1666666666673 [ | + | rect 555.3333333333333 986.1666666666673 615.3333333333333 1006.1666666666673 [[Malate_dehydrogenase|go to article]] |
| − | rect 386.0 589.0 486.0 609.0 [ | + | rect 386.0 589.0 486.0 609.0 [[Dihydroxyacetone_phosphate|go to article]] |
| − | rect 723.0 1081.0 823.0 1101.0 [ | + | rect 723.0 1081.0 823.0 1101.0 [[Pyruvic_acid|go to article]] |
| − | rect 386.0 135.655462184874 446.0 155.655462184874 [ | + | rect 386.0 135.655462184874 446.0 155.655462184874 [[GLUT2|go to article]] |
| − | rect 386.9999999999999 877.6666666666666 446.9999999999999 897.6666666666666 [ | + | rect 386.9999999999999 877.6666666666666 446.9999999999999 897.6666666666666 [[Enolase_2|go to article]] |
| − | rect 477.6500000000001 937.5 577.6500000000001 957.5 [ | + | rect 477.6500000000001 937.5 577.6500000000001 957.5 [[Oxaloacetic_acid|go to article]] |
| − | rect 386.99999999999994 427.61624649859937 446.99999999999994 447.61624649859937 [ | + | rect 386.99999999999994 427.61624649859937 446.99999999999994 447.61624649859937 [[Fructose_1,6-bisphosphatase|go to article]] |
| − | rect 384.8991596638656 272.6274509803923 444.8991596638656 292.6274509803923 [ | + | rect 384.8991596638656 272.6274509803923 444.8991596638656 292.6274509803923 [[G6PC|go to article]] |
| − | rect 386.0 195.655462184874 446.0 215.655462184874 [ | + | rect 386.0 195.655462184874 446.0 215.655462184874 [[GLUT5|go to article]] |
| − | rect 222.5 385.33333333333326 322.5 405.33333333333326 [ | + | rect 222.5 385.33333333333326 322.5 405.33333333333326 [[Fructose_6-phosphate|go to article]] |
| − | rect 695.6666666666667 1232.0 759.3333333333334 1252.0 [ | + | rect 695.6666666666667 1232.0 759.3333333333334 1252.0 [[E3_binding_protein|go to article]] |
| − | rect 386.99999999999994 497.66666666666674 446.99999999999994 517.6666666666667 [ | + | rect 386.99999999999994 497.66666666666674 446.99999999999994 517.6666666666667 [[Aldolase_A|go to article]] |
| − | rect 555.3333333333333 886.666666666667 615.3333333333333 906.666666666667 [ | + | rect 555.3333333333333 886.666666666667 615.3333333333333 906.666666666667 [[GOT1|go to article]] |
| − | rect 322.9999999999999 976.6666666666677 382.9999999999999 996.6666666666677 [ | + | rect 322.9999999999999 976.6666666666677 382.9999999999999 996.6666666666677 [[PCK1|go to article]] |
| − | rect 695.6666666666667 1132.0 759.3333333333334 1152.0 [ | + | rect 695.6666666666667 1132.0 759.3333333333334 1152.0 [[Pyruvate_dehydrogenase_(lipoamide)_alpha_1|go to article]] |
| − | rect 222.5 98.36666666666667 322.5 118.36666666666667 [ | + | rect 222.5 98.36666666666667 322.5 118.36666666666667 [[Glucose|go to article]] |
| − | rect 222.5 310.2745098039219 322.5 330.2745098039219 [ | + | rect 222.5 310.2745098039219 322.5 330.2745098039219 [[Glucose_6-phosphate|go to article]] |
| − | rect 695.6666666666667 1152.0 759.3333333333334 1172.0 [ | + | rect 695.6666666666667 1152.0 759.3333333333334 1172.0 [[Pyruvate_dehydrogenase_(lipoamide)_alpha_2|go to article]] |
| − | rect 657.9999999999997 987.3333333333335 717.9999999999997 1007.3333333333335 [ | + | rect 657.9999999999997 987.3333333333335 717.9999999999997 1007.3333333333335 [[Pyruvate_carboxylase|go to article]] |
| − | rect 222.5 744.0 322.5 764.0 [ | + | rect 222.5 744.0 322.5 764.0 [[3-Phosphoglyceric_acid|go to article]] |
| − | rect 386.9999999999999 691.6666666666673 446.9999999999999 711.6666666666673 [ | + | rect 386.9999999999999 691.6666666666673 446.9999999999999 711.6666666666673 [[PGK1|go to article]] |
| − | rect 386.9999999999999 838.6666666666666 446.9999999999999 858.6666666666666 [ | + | rect 386.9999999999999 838.6666666666666 446.9999999999999 858.6666666666666 [[Alpha-enolase|go to article]] |
| − | rect 386.99999999999994 407.61624649859937 446.99999999999994 427.61624649859937 [ | + | rect 386.99999999999994 407.61624649859937 446.99999999999994 427.61624649859937 [[Fructose_1,6-bisphosphatase|go to article]] |
| − | rect 801.0000000000001 940.5 901.0000000000001 960.5 [ | + | rect 801.0000000000001 940.5 901.0000000000001 960.5 [[Oxaloacetic_acid|go to article]] |
| − | rect 386.9999999999999 857.6666666666666 446.9999999999999 877.6666666666666 [ | + | rect 386.9999999999999 857.6666666666666 446.9999999999999 877.6666666666666 [[ENO3|go to article]] |
| − | rect 222.5 218.36666666666667 322.5 238.36666666666667 [ | + | rect 222.5 218.36666666666667 322.5 238.36666666666667 [[Glucose|go to article]] |
| − | rect 695.6666666666667 1172.0 759.3333333333334 1192.0 [ | + | rect 695.6666666666667 1172.0 759.3333333333334 1192.0 [[Pyruvate_dehydrogenase_(lipoamide)_beta|go to article]] |
| − | rect 386.99999999999994 537.6666666666666 446.99999999999994 557.6666666666666 [ | + | rect 386.99999999999994 537.6666666666666 446.99999999999994 557.6666666666666 [[Aldolase_C|go to article]] |
| − | rect 801.0 839.0 901.0 859.0 [ | + | rect 801.0 839.0 901.0 859.0 [[Aspartic_acid|go to article]] |
| − | rect 222.5 465.00000000000006 322.5 485.00000000000006 [ | + | rect 222.5 465.00000000000006 322.5 485.00000000000006 [[Fructose_1,6-bisphosphate|go to article]] |
| − | rect 222.5 889.3666666666667 322.5 909.3666666666667 [ | + | rect 222.5 889.3666666666667 322.5 909.3666666666667 [[Phosphoenolpyruvic_acid|go to article]] |
| − | rect 872.3333333333333 888.666666666667 932.3333333333333 908.666666666667 [ | + | rect 872.3333333333333 888.666666666667 932.3333333333333 908.666666666667 [[GOT2|go to article]] |
| − | rect 477.6500000000001 839.0 577.6500000000001 859.0 [ | + | rect 477.6500000000001 839.0 577.6500000000001 859.0 [[Aspartic_acid|go to article]] |
| − | rect 386.9999999999999 711.6666666666669 446.9999999999999 731.6666666666669 [ | + | rect 386.9999999999999 711.6666666666669 446.9999999999999 731.6666666666669 [[Phosphoglycerate_kinase|go to article]] |
| − | rect 695.6666666666667 1212.0 759.3333333333334 1232.0 [ | + | rect 695.6666666666667 1212.0 759.3333333333334 1232.0 [[Dihydrolipoamide_dehydrogenase|go to article]] |
| − | rect 477.6500000000001 1024.6666666666665 577.6500000000001 1044.6666666666665 [ | + | rect 477.6500000000001 1024.6666666666665 577.6500000000001 1044.6666666666665 [[Malic_acid|go to article]] |
| − | rect 222.5 664.0 322.5 684.0 [ | + | rect 222.5 664.0 322.5 684.0 [[1,3-Bisphosphoglyceric_acid|go to article]] |
| − | rect 222.5 1028.6666666666665 322.5 1048.6666666666665 [ | + | rect 222.5 1028.6666666666665 322.5 1048.6666666666665 [[Pyruvic_acid|go to article]] |
| − | rect 386.99999999999994 517.6666666666667 446.99999999999994 537.6666666666667 [ | + | rect 386.99999999999994 517.6666666666667 446.99999999999994 537.6666666666667 [[Aldolase_B|go to article]] |
| − | rect 386.0 175.655462184874 446.0 195.655462184874 [ | + | rect 386.0 175.655462184874 446.0 195.655462184874 [[GLUT4|go to article]] |
| − | rect 872.3333333333334 987.1666666666673 932.3333333333334 1007.1666666666673 [ | + | rect 872.3333333333334 987.1666666666673 932.3333333333334 1007.1666666666673 [[Malate_dehydrogenase_2|go to article]] |
| − | rect 329.33333333333303 624.6666666666662 389.33333333333303 644.6666666666662 [ | + | rect 329.33333333333303 624.6666666666662 389.33333333333303 644.6666666666662 [[TPI1|go to article]] |
| − | rect 222.5 583.6166666666667 322.5 603.6166666666667 [ | + | rect 222.5 583.6166666666667 322.5 603.6166666666667 [[Glyceraldehyde_3-phosphate|go to article]] |
| − | rect 773.5 1265.699999999998 873.5 1285.699999999998 [ | + | rect 773.5 1265.699999999998 873.5 1285.699999999998 [[Acetyl-CoA|go to article]] |
| − | rect 386.0 155.655462184874 446.0 175.655462184874 [ | + | rect 386.0 155.655462184874 446.0 175.655462184874 [[GLUT3|go to article]] |
| − | rect 386.9999999999999 344.4453781512607 446.9999999999999 364.4453781512607 [ | + | rect 386.9999999999999 344.4453781512607 446.9999999999999 364.4453781512607 [[Glucose-6-phosphate_isomerase|go to article]] |
| − | rect 386.0 115.65546218487401 446.0 135.655462184874 [ | + | rect 386.0 115.65546218487401 446.0 135.655462184874 [[GLUT1|go to article]] |
| − | rect 119.22128851540629 241.6778711484591 179.2212885154063 261.6778711484591 [ | + | rect 119.22128851540629 241.6778711484591 179.2212885154063 261.6778711484591 [[HK1|go to article]] |
| − | rect 119.22128851540629 301.6778711484597 179.2212885154063 321.6778711484597 [ | + | rect 119.22128851540629 301.6778711484597 179.2212885154063 321.6778711484597 [[Glucokinase|go to article]] |
| − | rect 119.22128851540629 281.6778711484597 179.2212885154063 301.6778711484597 [ | + | rect 119.22128851540629 281.6778711484597 179.2212885154063 301.6778711484597 [[HK3|go to article]] |
| − | rect 119.22128851540629 261.67787114845964 179.2212885154063 281.67787114845964 [ | + | rect 119.22128851540629 261.67787114845964 179.2212885154063 281.67787114845964 [[HK2|go to article]] |
| − | rect 117.66666666666674 420.6666666666664 177.66666666666674 440.6666666666664 [ | + | rect 117.66666666666674 420.6666666666664 177.66666666666674 440.6666666666664 [[PFKL|go to article]] |
| − | rect 117.66666666666674 400.6666666666664 177.66666666666674 420.6666666666664 [ | + | rect 117.66666666666674 400.6666666666664 177.66666666666674 420.6666666666664 [[PFKM|go to article]] |
| − | rect 117.66666666666674 440.6666666666664 177.66666666666674 460.6666666666664 [ | + | rect 117.66666666666674 440.6666666666664 177.66666666666674 460.6666666666664 [[PFKP|go to article]] |
| − | rect 125.00000000000004 611.3333333333335 188.33333333333337 631.3333333333335 [ | + | rect 125.00000000000004 611.3333333333335 188.33333333333337 631.3333333333335 [[GAPDHS|go to article]] |
| − | rect 125.00000000000004 631.3333333333335 188.33333333333337 651.3333333333335 [ | + | rect 125.00000000000004 631.3333333333335 188.33333333333337 651.3333333333335 [[Glyceraldehyde_3-phosphate_dehydrogenase|go to article]] |
| − | rect 113.00000000000006 794.3333333333333 173.00000000000006 814.3333333333333 [ | + | rect 113.00000000000006 794.3333333333333 173.00000000000006 814.3333333333333 [[Phosphoglycerate_mutase|go to article]] |
| − | rect 113.00000000000006 774.3333333333333 173.00000000000006 794.3333333333333 [ | + | rect 113.00000000000006 774.3333333333333 173.00000000000006 794.3333333333333 [[Phosphoglycerate_mutase|go to article]] |
| − | rect 104.29411764705867 947.3333333333331 164.29411764705867 967.3333333333331 [ | + | rect 104.29411764705867 947.3333333333331 164.29411764705867 967.3333333333331 [[PKM2|go to article]] |
| − | rect 104.29411764705867 967.3333333333331 164.29411764705867 987.3333333333331 [ | + | rect 104.29411764705867 967.3333333333331 164.29411764705867 987.3333333333331 [[PKLR|go to article]] |
| − | rect 104.29411764705867 927.3333333333334 164.29411764705867 947.3333333333334 [ | + | rect 104.29411764705867 927.3333333333334 164.29411764705867 947.3333333333334 [[PKM2|go to article]] |
| − | rect 89.0 1039.6666666666665 149.0 1059.6666666666665 [ | + | rect 89.0 1039.6666666666665 149.0 1059.6666666666665 [[Lactate_dehydrogenase|go to article]] |
| − | rect 89.0 1059.6666666666665 149.0 1079.6666666666665 [ | + | rect 89.0 1059.6666666666665 149.0 1079.6666666666665 [[LDHA|go to article]] |
| − | rect 89.0 1099.6666666666665 149.0 1119.6666666666665 [ | + | rect 89.0 1099.6666666666665 149.0 1119.6666666666665 [[Lactate_dehydrogenase|go to article]] |
| − | rect 89.0 1079.6666666666665 149.0 1099.6666666666665 [ | + | rect 89.0 1079.6666666666665 149.0 1099.6666666666665 [[Lactate_dehydrogenase|go to article]] |
| − | rect 197.3666666666667 1124.3666666666677 297.3666666666667 1144.3666666666677 [ | + | rect 197.3666666666667 1124.3666666666677 297.3666666666667 1144.3666666666677 [[Lactic_acid|go to article]] |
| − | rect 539.9495798319327 309.94117647058823 732.9495798319327 329.94117647058823 [ | + | rect 539.9495798319327 309.94117647058823 732.9495798319327 329.94117647058823 [[Pentose_phosphate_pathway|go to article]] |
rect 541.9495798319327 353.94117647058823 704.9495798319327 373.94117647058823 [http://www.wikipathways.org/index.php/Pathway:WP500 go to WikiPathways] | rect 541.9495798319327 353.94117647058823 704.9495798319327 373.94117647058823 [http://www.wikipathways.org/index.php/Pathway:WP500 go to WikiPathways] | ||
| − | rect 870.0 1144.0 965.0 1164.0 [ | + | rect 870.0 1144.0 965.0 1164.0 [[Citric_acid_cycle|go to article]] |
rect 593.0 1071.0 673.0 1091.0 [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/51660 go to Entrez] | rect 593.0 1071.0 673.0 1091.0 [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/51660 go to Entrez] | ||
| − | rect 593.0 1091.0 673.0 1111.0 [ | + | rect 593.0 1091.0 673.0 1111.0 [[BRP44|go to article]] |
| − | default [ | + | default [[Glycolysis#Interactive_pathway_map|Go to pathway article]] |
desc none | desc none | ||
</imagemap> | </imagemap> | ||
Revision as of 08:44, 17 September 2017
This template is the product of a custom export process of WikiPathways content as interactive pathway maps for Wikipedia articles. Please do not edit these templates directly as they include calculated hyperlinks and annotations based on original content curated at WikiPathways. Please feel free to edit and update the pathway content at WikiPathways. Your changes will be reflected here when the template is regenerated.
The collaborative design of this template, which is actually a set of nested templates with an image map at the core, was initially proposed and refined in collaboration with Gene Wiki and MCB. Please review the background of this discussion before making edits. Feel free to make suggestions in the associated talk pages.
The process of generating the content using this template involves a combination of scripts and manual steps detailed at https://github.com/wikipathways/Wikipedia-template. Feel free to contact WikiPathways if you need assistance updating or creating content using this template.
Features
- Gene links – click on blue-underlined gene boxes in pathway to go to the corresponding Gene Wiki article
- Metabolite links – click on blue-underlined metabolite boxes in pathway to go to the corresponding metabolite article
- Start new pages – click on red-underlined boxes to start a new Wikipedia article where one currently does not exist
- Bold self links – the gene or metabolite focused on in the current article is displayed as a bold-bordered self link
- Pathway links – click anywhere in the background on the pathway to go to the corresponding pathway article with an expanded view of the interactive pathway map
- Variable-controlled cropped view – pathway maps can be cropped by referencing a gene or metabolite (see Usages #2 and #3 below).
- Variable-controlled scroll view – pathway maps can be viewed in a scrollable window at a particular width and height (see Usage #4 below).
Usage
This template is commonly transcluded into the following types of articles in the following ways:
- Pathway articles
- Where you want to see the full pathway
{{TCACycle WP78}}- Gene Wiki articles
- Where you want to crop the pathway view to center on a particular gene
{{TCACycle WP78|highlight=Dihydrolipoyl_transacetylase}}- Metabolite articles
- Where you want to crop the pathway view to center on a particular metabolite
{{TCACycle WP78|highlight=Fumaric_acid}}- Miscellaneous
- Where you override default views and specify the width and height of a scrollable window in which to view the entire pathway
{{TCACycle WP78|width=600|height=300}}width: the width of the scrollable windowheight: the height of the scrollable window
- PLEASE DO NOT
- Please do not transclude below the References section or into other templates commonly transcluded below the Reference section. This produces a red warning (missing refs tag) due to the use of in-line references. Thank you!
Examples
- Citric acid cycle pathway (
{{TCACycle WP78}}) - DLAT gene wiki article (
{{GlycolysisGluconeogenesis_WP534}}) - Where is this template used?
Known issues
- When there is more than one copy of a gene or metabolite on a pathway, clicking on any copy will lead to the same page (as expected) and to the same highlighted and centered view (which may or may not be the particular copy you clicked on). This is because the highlighting and centering are determined by the variable passed in to the template and not by what exactly you click on. So, when using this template on a gene or metabolite article, take note of which copy (if there is more than one) is being highlighted in the view. The template knows about the other copies and you can choose which is the best representative copy to highlight by passing in the right variable. The first copy is given the name of the article (e.g., Apple_acid); additional copies are named "alt1", "alt2", etc. (e.g., Apple_acid__alt1). Note the two underscore characters between the name and the "alt" designation. In this way you can preview and decide which copy you want to highlight on a given gene or metabolite article.
- We do not have a public way of exporting pathways yet.
| The above documentation is transcluded from Template:Interactive pathway maps/doc. (edit | history) Editors can experiment in this template's sandbox (create | mirror) and testcases (create) pages. Subpages of this template. |
Click on genes, proteins and metabolites below to link to respective articles. [§ 1]
- ↑ The interactive pathway map can be edited at WikiPathways: "GlycolysisGluconeogenesis_WP534".
